May 15th, 2014

N2

Молекулярно-филогенетические курьезы. 4. Деревья для "бедных"

Pages from Antarctonemertes

Древо из статьи On the identity of two Antarctic brooding nemerteans: redescription of Antarctonemertes valida (Buerger, 1893)and description of a new species in the genus Antarctonemertes Friedrich, 1955 (Nemertea, Hoplonemertea) (Taboada et al., 2013// Polar.Biol.). на первый взгляд все вполне прилично – 4 гена. Но когда начинаешь смотреть материалы, то выясняется, что в анализ были включены виды не только с 4 сиквенсами, но также 3, 2 и даже одним. Стрелками я отметил виды рассматриваемого рода: у двух видов сиквенсы 4 генов, у одного – трех, и у одного – один сиквенс. Вначале я решил, что у меня просто галлюцинация, но потом выяснилось, что подобная «скользкая» практика действительно есть: если ОЧЕНЬ нужно включить в анализ вид, который имеет не все анализируемые сиквенсы, то есть подходы и программы, которые как бы «закрывают на это глаза». Вопрос в том, насколько такие данные репрезентативны. Конечно, в приличный журнал подобное дерево не «протолкнуть», даже несмотря на то, что один из соавторов довольно известный «молекулярщик».