olnud (olnud) wrote,
olnud
olnud

Category:

Знания и скорбь молекулярной филогенетики

Очередной, 69-ый номер Molecular Phylogenetics and Evolution посвящен проблемам митогеномики Metazoa, т.е. анализу митохондриальной ДНК. Большинство авторов – европейцы, отсюда и несколько «минорный» тон статей. В настоящее время мы имеем полные митохондриальные сиквенсы для более чем 2800 метазой, но от этого проблем меньше не стало – наоборот, со всей очевидностью очертилась невозможность построить с помощью имеющихся методов более или менее адекватные деревья, вскрывающие филогенетические отношения между типами Metazoa. Отсюда два не взаимоисключающих вывода: 1) сам по себе митохондриальный геном недостаточен для подобных построений, 2) методы построений деревьев нуждаются в серьезном осмыслении и новой реформе. Вот посмотрите древо из статьи «Mitogenomics does not resolve deep molluscan relationships (yet?)»:

Pages from Mollusca mitagenom

Видно, что там – «каша», причем не только в этом древе и в этой статье. Туникаты «вылетают» за пределы вторичноротых на многих глобальных деревьях; на «локальных» полная неразбериха внутри таких групп, как моллюски и членистоногие. Очевидно, что демонстрацию таких деревьев могли позволить себе только очень критичные ученые. Обычно всё строится иначе: производится отбор сиквенсов, выбрасывается все, что «путает картину», далее отбираются «хорошие деревья» - эксперименты с методами построений, с внешними группами и т.д. В итоге получается «красивое» древо, т.е. не вопиюще абсурдное. Некоторые из авторов статей настоящего номера – очень приличные морфологи, которые, очевидно, знают всю эту «алхимию» и не скрывают ее от широкой публики. Другой вопрос – изменит ли это что-либо? Ведь до сих пор во многих журналах статьи с плохими молекулярными деревьями считаются более современными, чем статьи с хорошими морфо-эволюционными реконструкциями.
Tags: зоология, моллюски, наука
Subscribe

  • Страшное Я

    Помню, как в начале 90-х мне в руки попал очередной сборник Зоологического института «Эволюционная морфология животных». Я читал одну статью за…

  • Фрагментарное 120

    Классические корпоративы в этом году у нас в институте не состоялись. Традиционный самодеятельный спектакль, который нам показывают сотрудники…

  • Прошел тайфун – идет другой

    В Приморье до сих пор ощутимы последствия недавнего тайфуна «Майсак». Соль с моря ветром разнесло на многие сотни метров – как результат, стекла на…

  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

  • 38 comments

  • Страшное Я

    Помню, как в начале 90-х мне в руки попал очередной сборник Зоологического института «Эволюционная морфология животных». Я читал одну статью за…

  • Фрагментарное 120

    Классические корпоративы в этом году у нас в институте не состоялись. Традиционный самодеятельный спектакль, который нам показывают сотрудники…

  • Прошел тайфун – идет другой

    В Приморье до сих пор ощутимы последствия недавнего тайфуна «Майсак». Соль с моря ветром разнесло на многие сотни метров – как результат, стекла на…