Википедийное
N2
olnud
Потихоньку пишу статьи в Википедию. Один знакомый был разочарован, узнав, что пишу я в основном о людях – ученых. Он ожидал статьи о разных животных. О животных напишут и без меня (я пока лишь правлю и дополняю), а о людях – не напишут, ибо человек у нас стал «ничем». Раз жизнь сводила меня с учеными, о которых есть, что написать – пишу. Павел Каганер помог освоить размещение не своих фотографий. Он, кстати, перевел статью о Харине на английский. Сделал странички об Алексее Рыбакове и Ольге Николаевне Зезиной.Сложнее всего пришлось со страничкой Решетняк Виталии Викторовны. Ее я никогда не видел, имя ее «табуировано» в отечественной профессиональной среде, никаких статей о ней не существует. Блестящий исследователь феодарий, радиолярий и акантарий, она прожила длинную, но драматичную жизнь. В 70-х в Зоологическом институте работали две известные «радиолярщицы»: Виталия Викторовна Решетняк и Мария Георгиевна Петрушевская. Между ними разразился глубокий профессиональный и личностный конфликт, который осложнился непростым характером обеих женщин. Финалом этого конфликта стало то, что в 1982 году Решетняк в возрасте 56 лет сократили, хотя годом раньше у нее вышла монография по акантариям, по которой она собиралась защищать докторскую. В 90-х из ЗИНа ушла Петрушевская – в монастырь. В итоге в ЗИНе не осталось специалистов по радиоляриям, коллекции Решетняк и Петрушевской пропали. Точную дату смерти Решетняк мне не смогли сообщить, телефон дочери молчит. Почему я о ней написал? Ее книга по феодариям – одна из моих любимых. Кому на ночь почитать стихи, а кому – полистать опеределитель…

Преподавательское: каникулы
N2
olnud
Прошла сессия. 4 курс дружно решил не получать стипендию и смело движется к отчислению. Они просто не пришли ни на отработки, ни на консультации. Релларион Эригранте оказалась довольно расторопной студенткой, быстро все сделала и сдала в последний день - так что никакой предвзятости, дело есть дело. И сейчас тишина, в коридорах пусто, на парковках почти нет машин (студенческих, конечно!).
***
За какие-то долги у университета заблокировали счета - не могут оплатить даже методичку (стоит это всего 6 тысяч). Но вот-вот счета должны разблокировать.
***
Read more...Collapse )

"I established kingdom....."
N2
olnud
Напомню старый анекдот: «90-ые прошлого века. Британский ученый возвращается из экспедиции и спрашивает коллегу, что произошло за год, пока его не было. «Всё как всегда: кризис в парламенте, сменилось пара министров, волнения в Северной Ирландии…да, и Томас Кавалье-Смит предложил очередную мегасистему». 2018 г.: анекдот по-прежнему актуален. Вышла статья Кавалье-Смита «Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences». Абстракт начинается по-королевски: «In 1981 I established kingdom Chromista…..». В статье предлагается широкий взгляд на хромист, которых практически все признают парафилетической группой: в версии настоящей статьи это большая группа SAR (=Harosa) + Hacrobia. Совсем недавно я спорил о хакробиях с одним фрэндом: он доказывал, что их практически никто не признает. А вот признал САМ:



Синапоморфией хромист признан симбиогенез с красной водорослью, ставшей их хлоропластом – как результат, лишенные каких-либо рудиментов хлоропластов радиолярии и фораминиферы все равно рассматриваются как потомки автотрофных организмов. Более того: если исходить из концепции Кавалье-Смита, Chlorarachnea потеряли хлоропласты «красного» происхождения, а потом обрели новые, но уже в результате эндосимбиоза с зелеными водорослями. В это нужно только верить! Все это интересно, но есть и откровенно грустные вещи. «Amphidinida ord. n. Diagnosis: plastids with peridinin and triple envelope; cingulum steeply loop-like, divides small pointed epicone from large rounded hypocone (Amphidinium, Bispinodinium)» - это только один из многочисленных новых таксонов, предложенных в статье (всего их там более 40 – от новых родов до новых подтипов). Кавалье-Смит спешит завершить свою Систему живого мира и не церемонится с обоснованиями и диагнозами. С прокариотами он потерпел фиаско: здесь все так бурно развивается, что постоянно открывают группы, которые переворачивают прежние представления. С эукариотами больше стабильности, хотя много противоречий: система Кавалье-Смита слишком не-филогенетична. И, тем не менее, огромное число предложенных им названий используется – в этом плане он более удачлив и прозорлив, чем его российский «аналог», Ярослав Игоревич Старобогатов, который «не угадал» новых веяний, и большинство предложенных им надвидовых таксонов было закрыто. А Кавалье-Смит перестал быть простым смертным, он единственный может писать в абстракте «I establish a new kingdom…». Ни один монарх в мире не может себе позволить подобного! Впрочем, и Кавалье-Смит уже не устанавливает новых царств - все они им установлены, и теперь остается разная "мелочь" вроде подтипов, классов, отрядов....

Микро-кракен
N2
olnud
В 2016 году описали Кракена... Нет, не того, который топил корабли. Этот Кракен столь мал, что его не видно невооруженным глазом:



Да, это одноклеточное - назвали его Kraken carinae, в честь мифического Кракена. Ложноножки этого существа чрезвычайно длинные - до 0.2-0.3 мм длиной (при том, что "тело" простейшего не превышает 10 мкм). Выделили его из почвенных проб, собранных в Европе. Молекулярно-филогенетический анализ показал, что это особая линия простейших группы Cercozoa, для которой предложено новое семейство Krakenidae. Питаются микро-кракены бактериями, при этом они чрезвычайно медленно двигаются. А куда им спешить? - Найдут и опишут...

Опять протест sci-hub
N2
olnud
Сегодня попробовал скачать статью через sci-hub - увы:

Сегодня, в день российской Науки

08.02.2018

работа сервиса Sci-Hub будет приостановлена в знак протеста

Сервис Sci-Hub работает в России с 2011 года. Появление этого сервиса стало гигантским прорывом для науки, особенно в России. Сайт фактически прорвал блокаду, котрая много лет закрывала ученым доступ к чтению научных журналов. За несколько лет миллионы ученых и студентов смогли получить доступ к научной литературе на сайте Sci-Hub. Очень многие российские ученые отзываются о сайте как о необходимом в работе и говорят, что им пользуются все: от студента до профессора. Статьи о проекте выходили в таких признанных научных журналах, как Science и Nature.

Почему же такой проект никак не отмечается ни премиями, ни как-либо еще? Его существование просто замалчивается и замыливается. Уже который год Министерство Образования и науки России с огромной помпой присуждает престижную премию "За верность науке". Но ни в списке лауреатов, ни в финалистах никогда не значится Sci-Hub, который за несколько лет бесперебойной работы доказал свою верность науке не словами, а делом. И особенно цинично это выглядит на фоне того, что в список финалистов этого года попал даже такой одиозный персонаж, как популяризатор Александр Панчин, который организовывал травлю создателя проекта Sci-Hub и вклад которого ни один разумный ученый никогда не поставит на одну ступень с тем, что делает Sci-Hub.

Некоторые связывают такую несправедливость с тем, что проект Sci-Hub находится в полулегальном поле. Но тогда возникает еще больше вопросов: почему такой проект, который незаменим в работе российских ученых - находится вне закона? Почему до сих пор не исправлены ошибки в законодательстве, из-за которых свободное распространение научной информации - считается нелегальным?

Давайте в этот день отдохнем от работы и задумаемся над тем, что происходит.


Интересно, а где-либо sci-hub отмечен премиями и наградами? Где-либо этот проект признали законным? Насколько я помню, ни один российский суд не признал работу sci-hub незаконной, и официально его никто не осуждал. Руководители РАН точно не выступали с критикой сайта. Наградить sci-hub - это в самом деле проблематично, едва ли найдется страна, готовая это сделать открыто. Но если кто-то наградит - я только за!

"Срастили" несращиваемое
N2
olnud
Эта работа прошла практически незамеченной, хотя она очень интересна. Посмотрите на две фотографии двух совершенно разных существ:



Вверху фото мейобентосного полипа Boreohydra simplex – неприкрепленного, живущего в илах, с тремя щупальцами - в общем, крошечного и странного. Внизу – медуза Plotocnide borealis, которая хотя и мелкая, но все же более 1 мм. Что между ними может быть общего? Группа ученых из России, США и Японии год назад опубликовала статью «DNA barcodes unite two problematic taxa: the meiobenthic Boreohydra simplex is a life-cycle stage of Plotocnide borealis (Hydrozoa: Aplanulata)», в которой на основе молекулярно-генетического анализа было показано, что этот полип и эта медуза – один вид. Вообще в книдариологии «срастить» разные стадии жизненного цикла гидроидов (которые очень часто описаны под разными видовыми и родовыми названиями) в одно целое – одна из важнейших задач, которую решают разными способами. Самым оптимальным является выращивание полипов в лабораторных условиях и получение у них медуз. Но с бореогидрой это сделать почти нереально: она живет в холодных водах на глубинах 15-300 м и непонятно, как ее вообще культивировать. Более простым способом в последние 20 лет стал анализ ДНК – он и показал, что бореогидра и протокнида – разные стадии одного вида. Но вот в чем необычность этого открытия: и бореогидра, и протокнида имеют половые клетки (яйцеклетки), т.е. способны размножаться половым путем. Поэтому ранее никто и не думал о том, что у берогидры может быть медуза – зачем ей она, если у бореогидры были найдены яйцеклетки? Это первый достоверный случай полового размножения одновременно у полипов и медуз у одного вида. Правда, особи со спермиями до сих пор не обнаружены – тоже интрига! И как такой крошечный полип "рождает" столь большую медузу - тоже неясно.

Фрагментарное 90
N2
olnud
Вот так выглядит наш институт (точнее - Центр) сейчас:



Позади института - замерзший Амурский залив. К Амуру он не имеет никакого отношения - это морской залив, но зимой он замерзает, привлекая множество любителей подледного лова. И хотя за выезд на лед полагается штраф, автолюбителей это не останавливает.
***
Неожиданно нам выплатили большую зарплату – в институте. Сказали, что это «президентские деньги». Но вот какого президента? Президенте нашего Центра, президенте РАН или президенте РФ?
***
Экспертиза проектов РФФИ выявила новую тенденцию, которая началась год-два назад: довольно много проектов, в заявках которых заявлены грандиозные планы, коллектив большой, в отчетах написано много разных результатов и указано много тезисов, но статей либо вообще нет, либо они в отечественных журналах без ИФ.

Главное - увидеть и показать
N2
olnud
Огромное число организмов никто никогда не видел живьем – так, как они ведут себя в естественных условиях. Во многом это относится к зоопланктону: его собирают планктонными сетками, фиксируют формалином и потом изучают. Есть, конечно, немало работ, в которых показана прижизненная окраска, проведены наблюдения за живыми особями, но это все требует особой усидчивости и много времени. В.Т. Шевяков, пока не стал министром, сидел, наблюдал и зарисовывал акантарий на Неаполитанской биологической станции так детально, что спустя 100 лет его рисунки и наблюдения остаются актуальными. А что теперь? Теперь актуальными стали видеонаблюдения с помощью микрокамер. Этому посвящена новая статья «Optics-based surveys of large unicellular zooplankton: a case study on radiolarians and phaeodarians». Авторы - ученые из Японии, лидеры в изучении радиолярий и феодарий. С помощью микрокамер получены прижизненные снимки ряда радиолярий и феодарий – и вот тут встает вопрос, что с этим делать? Как просто снимки сделать научно значимыми? Непростой вопрос – в многих журналах такое не опубликуешь. Хотя в Nature чего только не публикуют! Вот, например, недавнее сообщение «The rise of Rhizaria» - о тех же радиоляриях и феодариях: фактически, не о чем! Попробовал бы ученый из РФ сунуться туда с таким… Но японцы выбрали журнал, который реализует программу по визуализации планктонных организмов - Plankton & Benthos Research. Снимки не блещут высоким разрешением – это и понятно, т.к. организмы мелкие (шкала – 1 мм).



Научной ценности в этих снимках мало. Отмечу снимки L, M, N, O – на них показаны колонии феодарий. О колониальных радиоляриях написано немало (снимки E-G), а о колониальных феодариях неизвестно почти ничего, т.к. в ходе сбора колонии разрушаются. Пока это «проба пера» - в будущем, несомненно, качество снимков будет столь высоким, что по ним можно будет определять виды и различать тонкости морфологии. А пока – увидеть и показать другим, но не через фейсбук, а в журнальной статье.

Преподавательское: сессия
N2
olnud
В университете подняли зарплату – почти в два раза. Получил аванс 18 тысяч (и это полставки!). Очуметь…
***
Ввели новую систему принятия зачетов и экзаменов. Ведомость нужно сдавать не позже, чем на следующий день после экзамена. Те, кому в ведомости поставлено "не явился", могут сдавать только комиссии и после сессии. "Бегунки" отменяются. Но можно поставить "не допущен" - тогда студент может 1 раз сдать этот предмет в сессию, но должен написать заявление и получить согласие преподавателя принять зачет/экзамен в строго обозначенный день (и не позже!).
***
Хорошее настроение прибавили магистранты 2го года обучения – всем поставил отлично и все это заслужили. Студенты 3го курса порадовали избирательно, но были там очень хорошие индивидуальные работы.
***
4 курс настроение понизил – к экзамену никто не допущен из-за того, что не отработали пропущенные занятия. Предложенное одним из френдов задание сделать страничку в Википедии они провалили – неспособны… В четверг один из преподавателей приехал только ради них – никто не пришел, хотя сами договорились на этот день. По-хорошему – всех надо отчислять, но меня же «за всех» сожрут – 4ый курс отчислять нельзя! Но можно попытаться (пишу для студентов, если они это прочтут).
***
Одна из студенток прислала индивидуалку под именем Релларион Эригранте. До этого у меня был Фимас Полужид – вроде разобрался, откуда это. Но Релларион – видимо, что-то оригинальное. Нашел страничку в контакте: жизнеутверждающий девиз «проспать все нахер. пойти самой нахер». Студенты, видимо, не думают, что преподы интересуются ими больше, чем они нами. Вот бы я на своей страничке написал «Отчислить всех нахер. Уволиться самому нахер».
***
Ненавижу ситуации, когда один студент начинает спрашивать, как быть другому студенту только потому, что этот студент сам боится ко мне обратиться. Если 4-курсник не способен обратиться к преподавателю – это уже фатально. Все равно, что в армии дембель боится обратиться к старшему по званию – это возможно? Была у меня такая студентка – за нее просили, причем даже преподаватели, но я наотрез отказался ставить ей экзамен просто так. Ко мне она так и не подошла. В итоге серьезно больная студентка, ютившаяся по съемным квартирам, взяла академку, подлечилась, успешно родила ребенка и сейчас вполне счастлива на своей родине. Но сколько всего я услышал в свой адрес до этого! Одна девушка даже написала на моей рейтинговой страничке, что я ставлю личное выше остального и непрофессионален. Анонимно, конечно, но мне «добрые люди» донесли.

"W or V?" - вот в чем вопрос!
N2
olnud
Я много рассказываю о морских животных, часто столь диковинных, что многих из них мало кто вообще видели. А есть ли чудесные вещи рядом с нами? Конечно, есть – на любых объектах можно показать замысловатый эволюционный тренд. Хочу рассказать об обычных перловицах и беззубках. У всех нормальных двустворок есть скульптура раковины – тот рельеф, которым покрыта их раковина снаружи. Скульптура может быть очень разной, но она – визитная карточка конкретного вида или даже рода. У унионид (самой большой группы пресноводных моллюсков) есть одна особенность: обычная скульптура у них практически не развита, но есть так называемая макушечная скульптура. Выглядит она так:



Почему макушечная? Наиболее хорошо она развита у макушки раковины, но только если эта макушка не потерта временем и обстоятельствами. Рано лысеют не только мужчины с «лысой» наследственностью – у унионид очень часто (а у многих видов – почти всегда) с возрастом макушечная скульптура полностью стирается. Но она хорошо заметна у молодых раковин. Типов такой скульптуры несколько, но два типа выделяют особо – V-образная и W-образная. Посмотрите на самого обычного у нас Unio tumidus: видны остатки W-образной скульптуры.



Так откуда взялись все эти V и W, и зачем они нужны?
Read more...Collapse )

?

Log in

No account? Create an account